La Ingeniería Bioquímica se encarga de transformar los materiales biológicos para la generación de productos con valor social y comercial. Por ello, analiza los procesos biotecnológicos para el diseño, organización, control y operación de equipos y procesos aplicables en la transformación de materiales de origen orgánico (animal, vegetal y microbiano), con el propósito de satisfacer necesidades en sectores como alimentario, farmacéutico, agroindustrial, energético y medio ambiente.

La biotecnología completa la producción de los materiales biológicos mediante la bioconversión, utilizando sistemas biológicos tales como: Microorganismos (bacterias, hongos, levaduras y algas), Enzimas (proteasas, lipasas, ligasas) y Anticuerpos.

La actividad industrial que se realiza por medio de la biotecnología, constituye uno de los campos de desarrollo más importantes de esta carrera.